我校的《农产品运销学》课可以追溯到 1940 年代， 许道夫 教授引进农产品运销课程并主持讲授。文革期间中断，改革开放后，我校又率先恢复了《农产品运销学》课程， 李岳云 教授主持讲授， 1983 年在我校举办全国农业院校助教进修班，也讲授农产品运销学课程。
由于教材建设滞后， 1980 年代初，《农产品运销学》逐渐被《市场营销学》替代。 1980 年代末期，适应国际经济发展需要，在《市场营销学》的基础上新增设了《国际市场营销》课程，该课程为国际经济与贸易专业的专业课，将国际市场营销的基础知识较为全面地介绍给学生。
2000 年，周应恒教授从日本京都大学学成回国，同年在国内首次为研究生开设了《农产品运销》学课程。 2005 年，周应恒教授在全国率先为本科生开设《农产品运销学》课程，目的在于帮助学生全面理解与掌握在国民经济活动中，以满足消费者需求为目标实现农产品从生产者到消费者转移的一系列活动的机制、条件以及主要农产品的流通规律。《农产品运销学》与《市场营销学》相联系，但又有着本质的区别，农产品运销学在讲授过程中更多的引入经济学内容，强化了《农产品运销学》作为全国高等农业院校教学指导委员会农业经济学科组确定的农林经济管理专业 6 门专业基础课程之一的必 修课地位，逐渐扩展到整个经管类专业选修课与农学类的公共选修课。
2003 年起，周应恒授在整理多年《农产品运销学》研究生授课思路与内容的基础上，参照国际教学经验，在钟甫宁教授和李岳云教授的大力支持下，着手主编国内第 1 本《农产品运销学》教材。历经 3 年， 2006 年由中国农业出版社正式出版。该教材被列入国家“十五”、“十一五”规划教材，也成为“面向 21 世纪课程教材”，迅速被国内兄弟院校的同行选择使用。
近两年来，课程组逐渐扩充了《农产品运销学》的教学队伍，优秀年轻教师的引入，团队的讨论协作，使得教学方法更加灵活、教学资料更加丰富，利用网络强化学生的学习主动性和积极性。在实践环节，初步解决了实习基地无着落的难题，就近建立了多个主要教学实习基地（南京白云亭农产品批发市场、江苏苏果超市总部及南京主要门店、南京卫岗奶业集团等），由主讲老师指导，课程组其它两名青年教师带队在教学实践基地进行集中统一实习。通过实习，增强了学生实践操作能力和分析问题、解决问题的能力。还通过实习报告、课程论文，大学生科研训练（ SRT ）以及论文研讨会等形式强化实习效果。通过改革与完善，该课程逐渐适应了培养“应用型、复合型”农业经济管理专门人才的需要。
发展到今天，《农产品运销学》已经拥有了一直稳定、高效、团结的高素质教师队伍，引入启发式教学、案例教学、 SRT 指导与学生导师组制度等先进的实践教学方法，不断根据社会实际需要和国际学科发展前沿进行教学内容的充实更新，稳定发展并积极扩充教学实践（实习）基地。
2006 年，《农产品运销学》课程被南京农业大学评为校级精品课程。
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